棉籽中含有棉酚，在預(yù)處理工藝中需要進行高水分蒸炒，以減少毛油中棉酚的含量。經(jīng)過精煉的棉籽油完全食用安全。提高毛棉油的質(zhì)量。但棉籽餅粕中的棉酚，傳統(tǒng)制油方法制取的毛油和餅粕中含有棉酚，影響了餅粕的飼用價值。對餅粕需要經(jīng)過脫毒處理方可用作飼料。而**今沒有理想的脫毒工藝。
棉籽含殼39～52%，含仁48～61%。殼中含油0.3～1%。棉仁含油30～35%,含蛋白35～38%。棉籽中含有0.8～1.3%的棉酚。傳統(tǒng)的棉籽制油工藝是預(yù)榨浸出法或壓榨法。由于棉籽的含殼量較高且含有棉酚，因此，需要在預(yù)處理過程中進行剝殼并采用高水分蒸炒，以減少毛棉油中的棉酚含量。

常用的棉籽油加工成套設(shè)備的制油工藝：

棉籽→清理→剝殼→仁殼分離→軋胚→高水分蒸炒→預(yù)榨→浸出

棉籽油浸出設(shè)備

棉籽毛油中殘留的少量棉酚，可以在油脂堿煉脫酸過程中除去，不影響油品的質(zhì)量。去殼棉籽粕的蛋白質(zhì)含量達50～60%，且棉籽蛋白在質(zhì)量上近似于豆類蛋白，但由于棉籽粕中殘留棉酚的毒性，使其不能直接用作飼料，若用作飼料需要經(jīng)過專門的脫毒處理。因此很多地區(qū)只得將其作為肥料或限量用作反芻動物的飼料，造成蛋白資源的浪費。
對棉籽制油工藝也曾作過混合溶劑萃取，即利用棉酚在醇類溶劑中的溶解特性，采用混合溶劑（如己烷、乙醇或丙酮、水）從棉仁中同時將棉油和棉酚提取出來，以得到低棉酚含量的飼用棉籽粕。但此工藝在工業(yè)化生產(chǎn)中存在一些問題，如溶劑分離和回收困難，溶劑消耗大，成本高，混合溶劑萃取出的毛棉油中含有大量的棉酚和色素使油品質(zhì)量下降等。由此影響了此技術(shù)在工業(yè)上的推廣應(yīng)用。